三氟乙酸鹽

TFA

多肽產品通常為三氟乙酸鹽。由于三氟乙酸的生物毒性較大，部分實驗需要避免此鹽類型。

醋酸鹽

Ac

由于醋酸的生物毒性小，大部分藥物肽或美容肽為醋酸鹽。但部分產品的醋酸鹽穩定性不佳，需要考慮序列穩定性。

鹽酸鹽

HCl

較少產品會選擇鹽酸鹽。部分序列由于特殊用途，需要采用鹽酸鹽

銨鹽

NH4+

會嚴重影響產品的溶解性和穩定性，需要根據序列進行選擇。

鈉鹽

Na+

通常會影響產品的溶解性和穩定性

雙羥萘酸鹽

Pamoic acid

雙羥萘酸鹽通常用于多肽藥物制作緩釋劑

檸檬酸鹽

Citric Acid

生物毒性較小，但由于制備工藝較復雜，需要根據序列單獨開發生產工藝

水楊酸鹽

Salicylic acid

影響多肽產品的穩定性，較少采用